С 2008 г. музей размещается в здании восстановленного памятника архитектуры XVII века – городской ратуше. Это здание расположено в историческом центре Могилёва и является местом проведения городских торжеств и официальных приёмов городского исполнительного комитета.
Экспозиционные залы музея размещены на двух этажах. В них представлены предметы X - начала XX вв., связанных с историей Могилёва.
Музей знакомит посетителей с основными этапами исторического развития города, с его средневековой культурой, способами жизнеобеспечения, религией и частной жизнью. В теплое время года посетители могут подняться на смотровую площадку Ратуши, отсюда открывается панорамный вид на город, живописную излучину Днепра и заречные дали.
Куранты башенных часов ратуши, установленные на верхней площадке башни, имеют уникальный механизм, который приводятся в действие тяжёлыми гирями. В предместье Могилёва в 2004 г. с целью увековечивания подвига всех защитников Могилёва во время Великой Отечественной войны, и в особенности, воинов 388 стрелкового полка 172 стрелковой дивизии и ополченцев Могилёва открыт филиал музея – мемориальный комплекс «Буйничское поле».
Демонстрационная площадь музея составляет 3378 м2.
Действует 5 постоянных экспозиций.
Общее число музейных предметов составляет 13751, из них основного фонда 8965, научно-вспомогательного 4786. В 2013 г.создан выставочный зал.
В музее истории Могилева часто проводятся культурно-массовые мероприятия: ночь музеев (на площадке возле музея), свадебные обряды (торжественная регистрация бракосочетаний).